Bei primärer Tuberkulose ist die Läsion meist in Lymphknoten, Lunge, Pleura und manchmal auch in anderen Organen lokalisiert: Nieren, Gelenken, Knochen und Bauchfell. Der Bereich der spezifischen Entzündung kann sehr klein sein und bei der Untersuchung verborgen bleiben. Ist die Läsion groß, wird sie meist erst bei der klinischen und radiologischen Untersuchung des Patienten entdeckt.