Alloimmune oder isoimmune Neutropenie bei Neugeborenen tritt beim Fötus aufgrund einer antigenen Inkompatibilität der Neutrophilen des Fötus und der Mutter auf. Die Isoantikörper der Mutter gehören zur IgG-Klasse, durchdringen die Plazentaschranke und zerstören die Neutrophilen des Kindes. Isoantikörper sind in der Regel Leukoagglutinine und reagieren mit den Zellen des Patienten und seines Vaters, nicht jedoch mit den Zellen der Mutter.